３日午前４時半ごろ、県南部に上陸した台風６号の影響で、県内は２日から３日にかけて各地で強い風が吹き、南部を中心に大雨が降った。南部では３日未明に線状降水帯も発生。古座川にレベル５氾濫（はんらん）特別警報が発令された。
和歌山地方気象台によると、最大瞬間風速は潮岬で２８・７㍍、和歌山市で２６・２㍍、川辺は１９・９㍍。県の観測情報（３日午前７時半現在）によると、最大１時間雨量は新宮市の高田で８１㍉、累計雨量も同じく高田で５７６㍉を記録。日高地方でも印南町印南やみなべ町南部川で１時間に最大で３８㍉、ほとんどの地域で１００㍉以上の雨が降った。
午前３時３５分に那智勝浦町の太田川で堤防から越水して氾濫が発生。５時３５分には古座川にレベル５氾濫特別警報が発表された。
これらの影響で、古座川、串本町でレベル５緊急安全確保、新宮や田辺市、すさみ、那智勝浦町でレベル４避難指示、日高地方では御坊市や美浜、印南、みなべ町でレベル３高齢者等避難の避難情報を発令。日高地方では合わせて１６人が避難した。
県によると、けがをした人はいないが、海南市で住宅の窓から浸水、白浜と上富田町で土砂崩れ、すさみ町で雨漏り、古座川町で道路冠水、串本町で道路崩壊の合わせて６件の被害を確認。このほか、由良町大引―小引間の県道御坊由良線が越波の影響で約３３００㍍にわたり３日午前６時から通行止めとなっており、同日午後０時半現在も解除の見通しは立っていない。日高町では津久野地内で電柱が１本折れたが交通や停電の影響はないという。
